الفرق هو كيفية الوصول الى الهدف فالبرنامج الثاني طريقته هي الوصول الى الاستقلال المباشر والصريح مع الشعب وذلك بقيادة الرئيس علي سالم البيض بينما البرنامج الاول طريقته الوصول الى فك الارتباط عن طريق البوابة الخلفية (( الفيدرالية )) بقيادة كل من الرئيسين العطاس وعلي ناصر